首尾相搭荔枝AV污在线观看矩陣（Overlapping Peptide Library): 主要用於全蛋白掃描。首尾相搭的荔枝AV污在线观看矩陣是用於篩選線性或連續性表位的一種常用手段。這種肽庫的設計主要由肽長(peptide length)和步移(offset number) 兩個關鍵參數決定。蛋白從N端開始，逐步向C端截取設計後，最後很有可能會剩下一條孤肽(Orphan peptide)，荔枝AV污在线观看建議一般是將N端轉移一個或者幾個荔枝视频黄下载過來，以保持一致長度。

截頭荔枝AV污在线观看矩陣（Truncation Peptide Library）: 用於確定表位的最小範圍。截頭荔枝AV污在线观看矩陣的建立方法一般是係統性地去除原荔枝AV污在线观看序列兩側荔枝视频黄下载而得到的。頭荔枝AV污在线观看矩陣用於鑒定與活性有關的最少荔枝视频黄下载序列。

Ala篩選矩陣(Alanine Peptide Scanning Library): 用於鑒定荔枝AV污在线观看各位點對生物活性的影響。Ala被係統性地、依次地替代荔枝AV污在线观看序列中的每一個荔枝视频黄下载。通過Ala篩選肽庫以辨出某一特定荔枝视频黄下载對整個蛋白結構、功能和其他生物活性的影響。

隨機荔枝AV污在线观看文庫（Random Peptide Library）: 此荔枝AV污在线观看文庫的設計是以20種天然荔枝视频黄下载通過鳥槍式法（shotgun approach）同時地、隨機地取代被選擇的荔枝视频黄下载殘基。澤溪源的隨機荔枝AV污在线观看文庫在被選擇的荔枝视频黄下载中構建了盡可能多的突變。這類文庫中的替代肽有可能是增強荔枝AV污在线观看活性的。

Scrambled Peptide Library: 此類型庫的設計是基於原有荔枝AV污在线观看荔枝视频黄下载序列的內部置換。它是突變程度最高的荔枝AV污在线观看文庫，被攪亂的荔枝AV污在线观看通常被用於作為陰性對照證實某一特定序列是蛋白功能或活性的關健。它也是一個用來發現新目標的隨機篩選工具。

單位點掃描矩陣(Positional Scanning Peptide Library)： 用於序列改造以提高荔枝AV污在线观看活性。荔枝AV污在线观看某個選定的區域或位點被係統地用其他荔枝视频黄下载替換，這類肽庫有助於研究人員發現在某個特定位置上具有特殊影響或活性的特定區域。